Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
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Trim35Q8C006 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Trim35Q8C006 Dnajc5b-201ENSMUST00000029132 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Trim35Q8C006 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Trim35Q8C006 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Trbv20-201ENSMUST00000103277 335 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Gm13506-201ENSMUST00000120391 1083 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim35Q8C006 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms