Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXG3

Ift57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift57Q8BXG3 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ift57Q8BXG3 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ift57Q8BXG3 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ift57Q8BXG3 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ift57Q8BXG3 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ift57Q8BXG3 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ift57Q8BXG3 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ift57Q8BXG3 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ift57Q8BXG3 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ift57Q8BXG3 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ift57Q8BXG3 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ift57Q8BXG3 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ift57Q8BXG3 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ift57Q8BXG3 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ift57Q8BXG3 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ift57Q8BXG3 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ift57Q8BXG3 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ift57Q8BXG3 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ift57Q8BXG3 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ift57Q8BXG3 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ift57Q8BXG3 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ift57Q8BXG3 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ift57Q8BXG3 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ift57Q8BXG3 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ift57Q8BXG3 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ift57Q8BXG3 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ift57Q8BXG3 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ift57Q8BXG3 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ift57Q8BXG3 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ift57Q8BXG3 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ift57Q8BXG3 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ift57Q8BXG3 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ift57Q8BXG3 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ift57Q8BXG3 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ift57Q8BXG3 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ift57Q8BXG3 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ift57Q8BXG3 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ift57Q8BXG3 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ift57Q8BXG3 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ift57Q8BXG3 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ift57Q8BXG3 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ift57Q8BXG3 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ift57Q8BXG3 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ift57Q8BXG3 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ift57Q8BXG3 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ift57Q8BXG3 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ift57Q8BXG3 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ift57Q8BXG3 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ift57Q8BXG3 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ift57Q8BXG3 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ift57Q8BXG3 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ift57Q8BXG3 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ift57Q8BXG3 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ift57Q8BXG3 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ift57Q8BXG3 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ift57Q8BXG3 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ift57Q8BXG3 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ift57Q8BXG3 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ift57Q8BXG3 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ift57Q8BXG3 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ift57Q8BXG3 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Ift57Q8BXG3 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ift57Q8BXG3 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ift57Q8BXG3 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ift57Q8BXG3 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ift57Q8BXG3 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ift57Q8BXG3 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ift57Q8BXG3 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ift57Q8BXG3 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ift57Q8BXG3 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ift57Q8BXG3 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ift57Q8BXG3 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ift57Q8BXG3 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ift57Q8BXG3 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ift57Q8BXG3 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ift57Q8BXG3 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ift57Q8BXG3 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ift57Q8BXG3 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ift57Q8BXG3 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ift57Q8BXG3 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ift57Q8BXG3 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ift57Q8BXG3 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ift57Q8BXG3 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ift57Q8BXG3 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ift57Q8BXG3 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ift57Q8BXG3 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ift57Q8BXG3 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ift57Q8BXG3 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ift57Q8BXG3 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ift57Q8BXG3 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ift57Q8BXG3 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ift57Q8BXG3 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ift57Q8BXG3 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ift57Q8BXG3 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ift57Q8BXG3 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ift57Q8BXG3 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ift57Q8BXG3 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ift57Q8BXG3 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ift57Q8BXG3 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ift57Q8BXG3 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms