Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Snx17Q8BVL3 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Snx17Q8BVL3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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