Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms