Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT6

Tspan12, Tetraspanin-12, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan12Q8BKT6 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan12Q8BKT6 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan12Q8BKT6 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan12Q8BKT6 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan12Q8BKT6 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan12Q8BKT6 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan12Q8BKT6 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan12Q8BKT6 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan12Q8BKT6 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan12Q8BKT6 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan12Q8BKT6 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan12Q8BKT6 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan12Q8BKT6 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan12Q8BKT6 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan12Q8BKT6 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan12Q8BKT6 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan12Q8BKT6 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan12Q8BKT6 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan12Q8BKT6 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan12Q8BKT6 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan12Q8BKT6 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan12Q8BKT6 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan12Q8BKT6 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tspan12Q8BKT6 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tspan12Q8BKT6 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tspan12Q8BKT6 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tspan12Q8BKT6 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tspan12Q8BKT6 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tspan12Q8BKT6 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tspan12Q8BKT6 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tspan12Q8BKT6 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tspan12Q8BKT6 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tspan12Q8BKT6 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tspan12Q8BKT6 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tspan12Q8BKT6 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tspan12Q8BKT6 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tspan12Q8BKT6 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tspan12Q8BKT6 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tspan12Q8BKT6 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tspan12Q8BKT6 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tspan12Q8BKT6 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tspan12Q8BKT6 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tspan12Q8BKT6 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tspan12Q8BKT6 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tspan12Q8BKT6 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tspan12Q8BKT6 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tspan12Q8BKT6 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tspan12Q8BKT6 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tspan12Q8BKT6 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tspan12Q8BKT6 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tspan12Q8BKT6 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tspan12Q8BKT6 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tspan12Q8BKT6 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tspan12Q8BKT6 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tspan12Q8BKT6 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tspan12Q8BKT6 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tspan12Q8BKT6 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tspan12Q8BKT6 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tspan12Q8BKT6 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tspan12Q8BKT6 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tspan12Q8BKT6 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tspan12Q8BKT6 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tspan12Q8BKT6 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tspan12Q8BKT6 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tspan12Q8BKT6 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tspan12Q8BKT6 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tspan12Q8BKT6 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tspan12Q8BKT6 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tspan12Q8BKT6 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tspan12Q8BKT6 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tspan12Q8BKT6 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tspan12Q8BKT6 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tspan12Q8BKT6 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tspan12Q8BKT6 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tspan12Q8BKT6 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tspan12Q8BKT6 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tspan12Q8BKT6 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tspan12Q8BKT6 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tspan12Q8BKT6 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tspan12Q8BKT6 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tspan12Q8BKT6 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tspan12Q8BKT6 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tspan12Q8BKT6 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tspan12Q8BKT6 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tspan12Q8BKT6 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tspan12Q8BKT6 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tspan12Q8BKT6 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tspan12Q8BKT6 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tspan12Q8BKT6 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tspan12Q8BKT6 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tspan12Q8BKT6 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tspan12Q8BKT6 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tspan12Q8BKT6 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tspan12Q8BKT6 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tspan12Q8BKT6 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tspan12Q8BKT6 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tspan12Q8BKT6 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tspan12Q8BKT6 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tspan12Q8BKT6 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tspan12Q8BKT6 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms