Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

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Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Smarcal1Q8BJL0 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Smarcal1Q8BJL0 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Smarcal1Q8BJL0 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Smarcal1Q8BJL0 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Smarcal1Q8BJL0 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smarcal1Q8BJL0 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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