Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Cyp4f39Q8BGU0 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp4f39Q8BGU0 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms