Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Ubash3bQ8BGG7 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Ubash3bQ8BGG7 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms