Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc50Q810U5 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc50Q810U5 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc50Q810U5 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc50Q810U5 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc50Q810U5 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc50Q810U5 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc50Q810U5 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc50Q810U5 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc50Q810U5 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc50Q810U5 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc50Q810U5 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc50Q810U5 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc50Q810U5 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc50Q810U5 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc50Q810U5 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc50Q810U5 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc50Q810U5 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc50Q810U5 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc50Q810U5 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc50Q810U5 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc50Q810U5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc50Q810U5 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc50Q810U5 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc50Q810U5 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc50Q810U5 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc50Q810U5 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc50Q810U5 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc50Q810U5 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc50Q810U5 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc50Q810U5 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc50Q810U5 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc50Q810U5 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc50Q810U5 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc50Q810U5 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc50Q810U5 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc50Q810U5 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc50Q810U5 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc50Q810U5 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc50Q810U5 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc50Q810U5 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc50Q810U5 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc50Q810U5 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc50Q810U5 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc50Q810U5 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc50Q810U5 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc50Q810U5 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc50Q810U5 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc50Q810U5 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc50Q810U5 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc50Q810U5 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc50Q810U5 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc50Q810U5 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc50Q810U5 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc50Q810U5 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc50Q810U5 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc50Q810U5 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc50Q810U5 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc50Q810U5 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc50Q810U5 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ccdc50Q810U5 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ccdc50Q810U5 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc50Q810U5 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc50Q810U5 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc50Q810U5 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc50Q810U5 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc50Q810U5 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc50Q810U5 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc50Q810U5 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc50Q810U5 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc50Q810U5 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc50Q810U5 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc50Q810U5 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc50Q810U5 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc50Q810U5 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc50Q810U5 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc50Q810U5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc50Q810U5 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc50Q810U5 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc50Q810U5 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc50Q810U5 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc50Q810U5 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc50Q810U5 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc50Q810U5 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc50Q810U5 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc50Q810U5 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc50Q810U5 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc50Q810U5 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc50Q810U5 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc50Q810U5 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc50Q810U5 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc50Q810U5 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc50Q810U5 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc50Q810U5 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc50Q810U5 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc50Q810U5 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc50Q810U5 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc50Q810U5 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc50Q810U5 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc50Q810U5 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms