Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms