Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZS5

Cldn34b3, Claudin 34B3, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b3Q80ZS5 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn34b3Q80ZS5 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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