Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pja2Q80U04 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pja2Q80U04 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pja2Q80U04 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pja2Q80U04 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pja2Q80U04 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pja2Q80U04 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Pja2Q80U04 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pja2Q80U04 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Pja2Q80U04 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pja2Q80U04 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pja2Q80U04 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pja2Q80U04 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pja2Q80U04 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pja2Q80U04 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pja2Q80U04 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pja2Q80U04 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Pja2Q80U04 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pja2Q80U04 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pja2Q80U04 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pja2Q80U04 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Pja2Q80U04 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pja2Q80U04 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pja2Q80U04 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pja2Q80U04 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pja2Q80U04 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pja2Q80U04 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pja2Q80U04 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pja2Q80U04 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pja2Q80U04 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pja2Q80U04 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pja2Q80U04 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pja2Q80U04 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pja2Q80U04 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Pja2Q80U04 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pja2Q80U04 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pja2Q80U04 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pja2Q80U04 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pja2Q80U04 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pja2Q80U04 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Pja2Q80U04 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pja2Q80U04 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Pja2Q80U04 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pja2Q80U04 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pja2Q80U04 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pja2Q80U04 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Pja2Q80U04 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Pja2Q80U04 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Pja2Q80U04 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Pja2Q80U04 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms