Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NischQ80TM9 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC28.58■■■□□ 2.16
NischQ80TM9 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NischQ80TM9 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NischQ80TM9 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NischQ80TM9 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NischQ80TM9 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NischQ80TM9 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NischQ80TM9 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NischQ80TM9 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NischQ80TM9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NischQ80TM9 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NischQ80TM9 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NischQ80TM9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NischQ80TM9 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
NischQ80TM9 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NischQ80TM9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NischQ80TM9 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NischQ80TM9 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NischQ80TM9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NischQ80TM9 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NischQ80TM9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NischQ80TM9 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
NischQ80TM9 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NischQ80TM9 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NischQ80TM9 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
NischQ80TM9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NischQ80TM9 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NischQ80TM9 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NischQ80TM9 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NischQ80TM9 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NischQ80TM9 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NischQ80TM9 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NischQ80TM9 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
NischQ80TM9 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NischQ80TM9 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
NischQ80TM9 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NischQ80TM9 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NischQ80TM9 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NischQ80TM9 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NischQ80TM9 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NischQ80TM9 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NischQ80TM9 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NischQ80TM9 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
NischQ80TM9 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NischQ80TM9 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
NischQ80TM9 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NischQ80TM9 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NischQ80TM9 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NischQ80TM9 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NischQ80TM9 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NischQ80TM9 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NischQ80TM9 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NischQ80TM9 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NischQ80TM9 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NischQ80TM9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NischQ80TM9 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NischQ80TM9 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NischQ80TM9 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
NischQ80TM9 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NischQ80TM9 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms