Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH4

Ccp110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccp110Q7TSH4 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccp110Q7TSH4 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccp110Q7TSH4 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccp110Q7TSH4 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccp110Q7TSH4 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccp110Q7TSH4 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccp110Q7TSH4 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccp110Q7TSH4 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccp110Q7TSH4 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccp110Q7TSH4 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccp110Q7TSH4 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccp110Q7TSH4 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccp110Q7TSH4 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccp110Q7TSH4 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccp110Q7TSH4 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccp110Q7TSH4 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccp110Q7TSH4 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccp110Q7TSH4 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccp110Q7TSH4 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccp110Q7TSH4 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccp110Q7TSH4 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccp110Q7TSH4 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccp110Q7TSH4 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccp110Q7TSH4 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccp110Q7TSH4 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccp110Q7TSH4 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccp110Q7TSH4 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccp110Q7TSH4 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccp110Q7TSH4 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccp110Q7TSH4 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccp110Q7TSH4 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccp110Q7TSH4 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccp110Q7TSH4 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccp110Q7TSH4 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccp110Q7TSH4 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccp110Q7TSH4 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccp110Q7TSH4 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccp110Q7TSH4 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccp110Q7TSH4 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms