Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prrc2bQ7TPM1 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prrc2bQ7TPM1 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prrc2bQ7TPM1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prrc2bQ7TPM1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prrc2bQ7TPM1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prrc2bQ7TPM1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prrc2bQ7TPM1 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prrc2bQ7TPM1 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prrc2bQ7TPM1 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prrc2bQ7TPM1 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prrc2bQ7TPM1 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prrc2bQ7TPM1 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prrc2bQ7TPM1 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prrc2bQ7TPM1 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prrc2bQ7TPM1 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prrc2bQ7TPM1 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prrc2bQ7TPM1 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prrc2bQ7TPM1 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prrc2bQ7TPM1 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Prrc2bQ7TPM1 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prrc2bQ7TPM1 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prrc2bQ7TPM1 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prrc2bQ7TPM1 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prrc2bQ7TPM1 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prrc2bQ7TPM1 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prrc2bQ7TPM1 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prrc2bQ7TPM1 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prrc2bQ7TPM1 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prrc2bQ7TPM1 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prrc2bQ7TPM1 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prrc2bQ7TPM1 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prrc2bQ7TPM1 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Prrc2bQ7TPM1 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prrc2bQ7TPM1 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prrc2bQ7TPM1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prrc2bQ7TPM1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prrc2bQ7TPM1 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prrc2bQ7TPM1 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prrc2bQ7TPM1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prrc2bQ7TPM1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prrc2bQ7TPM1 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prrc2bQ7TPM1 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prrc2bQ7TPM1 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prrc2bQ7TPM1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prrc2bQ7TPM1 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prrc2bQ7TPM1 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prrc2bQ7TPM1 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Prrc2bQ7TPM1 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prrc2bQ7TPM1 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prrc2bQ7TPM1 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prrc2bQ7TPM1 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prrc2bQ7TPM1 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prrc2bQ7TPM1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prrc2bQ7TPM1 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prrc2bQ7TPM1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prrc2bQ7TPM1 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prrc2bQ7TPM1 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prrc2bQ7TPM1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prrc2bQ7TPM1 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prrc2bQ7TPM1 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Prrc2bQ7TPM1 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prrc2bQ7TPM1 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prrc2bQ7TPM1 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prrc2bQ7TPM1 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prrc2bQ7TPM1 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prrc2bQ7TPM1 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prrc2bQ7TPM1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prrc2bQ7TPM1 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Prrc2bQ7TPM1 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Prrc2bQ7TPM1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Prrc2bQ7TPM1 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Prrc2bQ7TPM1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Prrc2bQ7TPM1 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Prrc2bQ7TPM1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Prrc2bQ7TPM1 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Prrc2bQ7TPM1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Prrc2bQ7TPM1 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms