Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp397Q7TNK4 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms