Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nphp3Q7TNH6 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms