Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rph3alQ768S4 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rph3alQ768S4 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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