Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SynmQ70IV5 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms