Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Cnih3Q6ZWS4 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Cnih3Q6ZWS4 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih3Q6ZWS4 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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