Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atp8b3Q6UQ17 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp8b3Q6UQ17 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms