Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

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Length 828 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Med16Q6PGF3 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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