Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smarca2Q6DIC0 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Smarca2Q6DIC0 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms