Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nop58Q6DFW4 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nop58Q6DFW4 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nop58Q6DFW4 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nop58Q6DFW4 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nop58Q6DFW4 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nop58Q6DFW4 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nop58Q6DFW4 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nop58Q6DFW4 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nop58Q6DFW4 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nop58Q6DFW4 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nop58Q6DFW4 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nop58Q6DFW4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nop58Q6DFW4 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nop58Q6DFW4 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nop58Q6DFW4 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nop58Q6DFW4 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nop58Q6DFW4 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nop58Q6DFW4 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nop58Q6DFW4 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nop58Q6DFW4 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nop58Q6DFW4 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nop58Q6DFW4 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nop58Q6DFW4 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nop58Q6DFW4 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nop58Q6DFW4 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nop58Q6DFW4 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nop58Q6DFW4 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nop58Q6DFW4 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nop58Q6DFW4 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nop58Q6DFW4 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nop58Q6DFW4 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nop58Q6DFW4 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nop58Q6DFW4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nop58Q6DFW4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nop58Q6DFW4 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nop58Q6DFW4 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Nop58Q6DFW4 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nop58Q6DFW4 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nop58Q6DFW4 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nop58Q6DFW4 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nop58Q6DFW4 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nop58Q6DFW4 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nop58Q6DFW4 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nop58Q6DFW4 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nop58Q6DFW4 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nop58Q6DFW4 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nop58Q6DFW4 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nop58Q6DFW4 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nop58Q6DFW4 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nop58Q6DFW4 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nop58Q6DFW4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nop58Q6DFW4 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nop58Q6DFW4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nop58Q6DFW4 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nop58Q6DFW4 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nop58Q6DFW4 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nop58Q6DFW4 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nop58Q6DFW4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nop58Q6DFW4 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nop58Q6DFW4 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nop58Q6DFW4 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nop58Q6DFW4 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nop58Q6DFW4 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nop58Q6DFW4 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nop58Q6DFW4 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nop58Q6DFW4 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nop58Q6DFW4 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nop58Q6DFW4 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nop58Q6DFW4 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nop58Q6DFW4 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nop58Q6DFW4 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nop58Q6DFW4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nop58Q6DFW4 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nop58Q6DFW4 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nop58Q6DFW4 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nop58Q6DFW4 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nop58Q6DFW4 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nop58Q6DFW4 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nop58Q6DFW4 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nop58Q6DFW4 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nop58Q6DFW4 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nop58Q6DFW4 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nop58Q6DFW4 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nop58Q6DFW4 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nop58Q6DFW4 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nop58Q6DFW4 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nop58Q6DFW4 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Nop58Q6DFW4 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Nop58Q6DFW4 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Nop58Q6DFW4 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Nop58Q6DFW4 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Nop58Q6DFW4 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Nop58Q6DFW4 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Nop58Q6DFW4 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Nop58Q6DFW4 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Nop58Q6DFW4 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Nop58Q6DFW4 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Nop58Q6DFW4 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Nop58Q6DFW4 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms