Protein–RNA interactions for Protein: Q6BCL1

Pram1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, mousemouse

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Length 675 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pram1Q6BCL1 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pram1Q6BCL1 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pram1Q6BCL1 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pram1Q6BCL1 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pram1Q6BCL1 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pram1Q6BCL1 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pram1Q6BCL1 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pram1Q6BCL1 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pram1Q6BCL1 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pram1Q6BCL1 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pram1Q6BCL1 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pram1Q6BCL1 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pram1Q6BCL1 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pram1Q6BCL1 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pram1Q6BCL1 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pram1Q6BCL1 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pram1Q6BCL1 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pram1Q6BCL1 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pram1Q6BCL1 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pram1Q6BCL1 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pram1Q6BCL1 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pram1Q6BCL1 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pram1Q6BCL1 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pram1Q6BCL1 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pram1Q6BCL1 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pram1Q6BCL1 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pram1Q6BCL1 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pram1Q6BCL1 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pram1Q6BCL1 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pram1Q6BCL1 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pram1Q6BCL1 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pram1Q6BCL1 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pram1Q6BCL1 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pram1Q6BCL1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pram1Q6BCL1 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pram1Q6BCL1 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pram1Q6BCL1 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pram1Q6BCL1 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pram1Q6BCL1 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pram1Q6BCL1 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pram1Q6BCL1 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pram1Q6BCL1 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pram1Q6BCL1 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pram1Q6BCL1 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pram1Q6BCL1 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pram1Q6BCL1 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pram1Q6BCL1 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pram1Q6BCL1 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pram1Q6BCL1 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pram1Q6BCL1 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pram1Q6BCL1 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pram1Q6BCL1 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pram1Q6BCL1 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pram1Q6BCL1 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pram1Q6BCL1 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pram1Q6BCL1 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pram1Q6BCL1 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms