Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pdzrn3Q69ZS0 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdzrn3Q69ZS0 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdzrn3Q69ZS0 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdzrn3Q69ZS0 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdzrn3Q69ZS0 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
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Pdzrn3Q69ZS0 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdzrn3Q69ZS0 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdzrn3Q69ZS0 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdzrn3Q69ZS0 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdzrn3Q69ZS0 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdzrn3Q69ZS0 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdzrn3Q69ZS0 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdzrn3Q69ZS0 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdzrn3Q69ZS0 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdzrn3Q69ZS0 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdzrn3Q69ZS0 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdzrn3Q69ZS0 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdzrn3Q69ZS0 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdzrn3Q69ZS0 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdzrn3Q69ZS0 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdzrn3Q69ZS0 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdzrn3Q69ZS0 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdzrn3Q69ZS0 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdzrn3Q69ZS0 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdzrn3Q69ZS0 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdzrn3Q69ZS0 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdzrn3Q69ZS0 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdzrn3Q69ZS0 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdzrn3Q69ZS0 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdzrn3Q69ZS0 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdzrn3Q69ZS0 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdzrn3Q69ZS0 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdzrn3Q69ZS0 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdzrn3Q69ZS0 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdzrn3Q69ZS0 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pdzrn3Q69ZS0 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pdzrn3Q69ZS0 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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