Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Msl2Q69ZF8 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Msl2Q69ZF8 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Msl2Q69ZF8 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Msl2Q69ZF8 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Msl2Q69ZF8 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Msl2Q69ZF8 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Msl2Q69ZF8 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Msl2Q69ZF8 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms