Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg9aQ68FE2 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg9aQ68FE2 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg9aQ68FE2 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg9aQ68FE2 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg9aQ68FE2 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg9aQ68FE2 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg9aQ68FE2 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg9aQ68FE2 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg9aQ68FE2 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg9aQ68FE2 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg9aQ68FE2 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg9aQ68FE2 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg9aQ68FE2 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg9aQ68FE2 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg9aQ68FE2 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg9aQ68FE2 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg9aQ68FE2 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg9aQ68FE2 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg9aQ68FE2 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg9aQ68FE2 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg9aQ68FE2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms