Protein–RNA interactions for Protein: Q64104

Nr2e1, Nuclear receptor subfamily 2 group E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e1Q64104 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr2e1Q64104 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr2e1Q64104 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr2e1Q64104 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr2e1Q64104 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr2e1Q64104 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr2e1Q64104 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr2e1Q64104 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr2e1Q64104 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr2e1Q64104 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr2e1Q64104 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr2e1Q64104 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr2e1Q64104 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr2e1Q64104 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr2e1Q64104 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr2e1Q64104 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nr2e1Q64104 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr2e1Q64104 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr2e1Q64104 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr2e1Q64104 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr2e1Q64104 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr2e1Q64104 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr2e1Q64104 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr2e1Q64104 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr2e1Q64104 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr2e1Q64104 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr2e1Q64104 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr2e1Q64104 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr2e1Q64104 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr2e1Q64104 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr2e1Q64104 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr2e1Q64104 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr2e1Q64104 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr2e1Q64104 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr2e1Q64104 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr2e1Q64104 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr2e1Q64104 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr2e1Q64104 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr2e1Q64104 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr2e1Q64104 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr2e1Q64104 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr2e1Q64104 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr2e1Q64104 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr2e1Q64104 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr2e1Q64104 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr2e1Q64104 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr2e1Q64104 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr2e1Q64104 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr2e1Q64104 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr2e1Q64104 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr2e1Q64104 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr2e1Q64104 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr2e1Q64104 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr2e1Q64104 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr2e1Q64104 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nr2e1Q64104 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nr2e1Q64104 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nr2e1Q64104 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nr2e1Q64104 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nr2e1Q64104 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nr2e1Q64104 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nr2e1Q64104 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nr2e1Q64104 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr2e1Q64104 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr2e1Q64104 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr2e1Q64104 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr2e1Q64104 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr2e1Q64104 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nr2e1Q64104 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Nr2e1Q64104 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nr2e1Q64104 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr2e1Q64104 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr2e1Q64104 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Nr2e1Q64104 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Nr2e1Q64104 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr2e1Q64104 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr2e1Q64104 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr2e1Q64104 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nr2e1Q64104 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr2e1Q64104 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr2e1Q64104 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr2e1Q64104 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr2e1Q64104 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr2e1Q64104 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr2e1Q64104 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr2e1Q64104 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr2e1Q64104 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr2e1Q64104 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr2e1Q64104 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr2e1Q64104 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr2e1Q64104 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr2e1Q64104 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr2e1Q64104 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr2e1Q64104 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr2e1Q64104 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr2e1Q64104 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nr2e1Q64104 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nr2e1Q64104 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nr2e1Q64104 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nr2e1Q64104 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms