Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col4a5Q63ZW6 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Col4a5Q63ZW6 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Col4a5Q63ZW6 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Col4a5Q63ZW6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Col4a5Q63ZW6 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Col4a5Q63ZW6 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Col4a5Q63ZW6 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Col4a5Q63ZW6 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Col4a5Q63ZW6 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Col4a5Q63ZW6 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Col4a5Q63ZW6 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Col4a5Q63ZW6 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Col4a5Q63ZW6 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Col4a5Q63ZW6 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Col4a5Q63ZW6 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Col4a5Q63ZW6 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Col4a5Q63ZW6 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Col4a5Q63ZW6 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Col4a5Q63ZW6 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Col4a5Q63ZW6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Col4a5Q63ZW6 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Col4a5Q63ZW6 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col4a5Q63ZW6 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col4a5Q63ZW6 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col4a5Q63ZW6 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col4a5Q63ZW6 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col4a5Q63ZW6 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Col4a5Q63ZW6 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col4a5Q63ZW6 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col4a5Q63ZW6 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col4a5Q63ZW6 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms