Protein–RNA interactions for Protein: Q62393

Tpd52, Tumor protein D52, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52Q62393 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpd52Q62393 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms