Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sycp1Q62209 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms