Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Sin3bQ62141 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Sin3bQ62141 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Sin3bQ62141 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Sin3bQ62141 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Sin3bQ62141 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Sin3bQ62141 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sin3bQ62141 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Sin3bQ62141 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Sin3bQ62141 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sin3bQ62141 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Sin3bQ62141 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sin3bQ62141 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sin3bQ62141 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sin3bQ62141 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sin3bQ62141 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sin3bQ62141 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sin3bQ62141 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sin3bQ62141 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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