Protein–RNA interactions for Protein: Q61626

Grik5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik5Q61626 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Grik5Q61626 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Grik5Q61626 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Grik5Q61626 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik5Q61626 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik5Q61626 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik5Q61626 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik5Q61626 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik5Q61626 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik5Q61626 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik5Q61626 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik5Q61626 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik5Q61626 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik5Q61626 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik5Q61626 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik5Q61626 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik5Q61626 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik5Q61626 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik5Q61626 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik5Q61626 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik5Q61626 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik5Q61626 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik5Q61626 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik5Q61626 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik5Q61626 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik5Q61626 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik5Q61626 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms