Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Foxd1Q61345 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms