Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf3Q60803 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms