Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atf3Q60765 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atf3Q60765 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atf3Q60765 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atf3Q60765 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Atf3Q60765 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atf3Q60765 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atf3Q60765 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atf3Q60765 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atf3Q60765 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atf3Q60765 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Atf3Q60765 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atf3Q60765 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Atf3Q60765 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atf3Q60765 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atf3Q60765 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atf3Q60765 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Atf3Q60765 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Atf3Q60765 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atf3Q60765 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Atf3Q60765 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atf3Q60765 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atf3Q60765 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atf3Q60765 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atf3Q60765 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atf3Q60765 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atf3Q60765 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atf3Q60765 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atf3Q60765 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atf3Q60765 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atf3Q60765 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Atf3Q60765 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atf3Q60765 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atf3Q60765 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atf3Q60765 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atf3Q60765 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atf3Q60765 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atf3Q60765 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atf3Q60765 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atf3Q60765 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Atf3Q60765 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Atf3Q60765 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atf3Q60765 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atf3Q60765 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Atf3Q60765 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atf3Q60765 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atf3Q60765 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atf3Q60765 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atf3Q60765 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atf3Q60765 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atf3Q60765 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atf3Q60765 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atf3Q60765 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atf3Q60765 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atf3Q60765 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atf3Q60765 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atf3Q60765 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atf3Q60765 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Atf3Q60765 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atf3Q60765 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atf3Q60765 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atf3Q60765 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atf3Q60765 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atf3Q60765 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atf3Q60765 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atf3Q60765 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atf3Q60765 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atf3Q60765 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atf3Q60765 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atf3Q60765 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atf3Q60765 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atf3Q60765 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atf3Q60765 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atf3Q60765 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atf3Q60765 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atf3Q60765 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atf3Q60765 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atf3Q60765 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atf3Q60765 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atf3Q60765 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atf3Q60765 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atf3Q60765 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Atf3Q60765 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atf3Q60765 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atf3Q60765 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atf3Q60765 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atf3Q60765 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atf3Q60765 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atf3Q60765 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Atf3Q60765 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms