Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CttnQ60598 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CttnQ60598 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CttnQ60598 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CttnQ60598 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CttnQ60598 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CttnQ60598 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CttnQ60598 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CttnQ60598 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms