Protein–RNA interactions for Protein: Q60596

Xrcc1, DNA repair protein XRCC1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc1Q60596 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Xrcc1Q60596 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Xrcc1Q60596 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Xrcc1Q60596 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Xrcc1Q60596 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Xrcc1Q60596 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Xrcc1Q60596 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Xrcc1Q60596 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Xrcc1Q60596 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Xrcc1Q60596 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Xrcc1Q60596 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Xrcc1Q60596 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Xrcc1Q60596 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Xrcc1Q60596 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Xrcc1Q60596 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Xrcc1Q60596 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Xrcc1Q60596 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Xrcc1Q60596 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Xrcc1Q60596 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Xrcc1Q60596 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Xrcc1Q60596 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Xrcc1Q60596 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Xrcc1Q60596 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Xrcc1Q60596 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Xrcc1Q60596 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Xrcc1Q60596 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Xrcc1Q60596 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Xrcc1Q60596 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Xrcc1Q60596 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Xrcc1Q60596 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Xrcc1Q60596 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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