Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUD9

Bbs12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs12Q5SUD9 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Bbs12Q5SUD9 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.9 ms