Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc85aQ5SP85 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms