Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

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Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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Trim58Q5NCC9 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
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Trim58Q5NCC9 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim58Q5NCC9 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms