Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Taf3Q5HZG4 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms