Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M8

BC051142, Testis specific basic protein, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051142Q3V0M8 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
BC051142Q3V0M8 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms