Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0J4

Ankrd53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd53Q3V0J4 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Ankrd53Q3V0J4 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ankrd53Q3V0J4 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ankrd53Q3V0J4 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ankrd53Q3V0J4 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ankrd53Q3V0J4 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ankrd53Q3V0J4 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Ankrd53Q3V0J4 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ankrd53Q3V0J4 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ankrd53Q3V0J4 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Ankrd53Q3V0J4 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ankrd53Q3V0J4 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Ankrd53Q3V0J4 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ankrd53Q3V0J4 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ankrd53Q3V0J4 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ankrd53Q3V0J4 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ankrd53Q3V0J4 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ankrd53Q3V0J4 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ankrd53Q3V0J4 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ankrd53Q3V0J4 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Ankrd53Q3V0J4 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ankrd53Q3V0J4 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ankrd53Q3V0J4 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ankrd53Q3V0J4 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ankrd53Q3V0J4 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ankrd53Q3V0J4 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Ankrd53Q3V0J4 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Ankrd53Q3V0J4 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Ankrd53Q3V0J4 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ankrd53Q3V0J4 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ankrd53Q3V0J4 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ankrd53Q3V0J4 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Ankrd53Q3V0J4 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Ankrd53Q3V0J4 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ankrd53Q3V0J4 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Ankrd53Q3V0J4 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ankrd53Q3V0J4 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ankrd53Q3V0J4 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ankrd53Q3V0J4 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Ankrd53Q3V0J4 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ankrd53Q3V0J4 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ankrd53Q3V0J4 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ankrd53Q3V0J4 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ankrd53Q3V0J4 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ankrd53Q3V0J4 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ankrd53Q3V0J4 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ankrd53Q3V0J4 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ankrd53Q3V0J4 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ankrd53Q3V0J4 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ankrd53Q3V0J4 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ankrd53Q3V0J4 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ankrd53Q3V0J4 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ankrd53Q3V0J4 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ankrd53Q3V0J4 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ankrd53Q3V0J4 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ankrd53Q3V0J4 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ankrd53Q3V0J4 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ankrd53Q3V0J4 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ankrd53Q3V0J4 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ankrd53Q3V0J4 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ankrd53Q3V0J4 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ankrd53Q3V0J4 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms