Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
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Usp48Q3V0C5 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp48Q3V0C5 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp48Q3V0C5 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp48Q3V0C5 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp48Q3V0C5 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp48Q3V0C5 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp48Q3V0C5 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp48Q3V0C5 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp48Q3V0C5 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp48Q3V0C5 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp48Q3V0C5 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp48Q3V0C5 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp48Q3V0C5 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp48Q3V0C5 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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Usp48Q3V0C5 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp48Q3V0C5 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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Usp48Q3V0C5 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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Usp48Q3V0C5 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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Usp48Q3V0C5 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp48Q3V0C5 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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Usp48Q3V0C5 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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Usp48Q3V0C5 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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Usp48Q3V0C5 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp48Q3V0C5 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp48Q3V0C5 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp48Q3V0C5 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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Usp48Q3V0C5 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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Usp48Q3V0C5 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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Usp48Q3V0C5 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp48Q3V0C5 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp48Q3V0C5 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp48Q3V0C5 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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Usp48Q3V0C5 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
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Usp48Q3V0C5 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp48Q3V0C5 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp48Q3V0C5 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp48Q3V0C5 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp48Q3V0C5 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp48Q3V0C5 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp48Q3V0C5 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp48Q3V0C5 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp48Q3V0C5 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp48Q3V0C5 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp48Q3V0C5 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp48Q3V0C5 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp48Q3V0C5 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp48Q3V0C5 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp48Q3V0C5 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp48Q3V0C5 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp48Q3V0C5 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp48Q3V0C5 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp48Q3V0C5 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp48Q3V0C5 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp48Q3V0C5 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp48Q3V0C5 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp48Q3V0C5 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp48Q3V0C5 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp48Q3V0C5 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp48Q3V0C5 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp48Q3V0C5 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
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