Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ttc9Q3V038 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ttc9Q3V038 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc9Q3V038 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc9Q3V038 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ttc9Q3V038 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc9Q3V038 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ttc9Q3V038 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ttc9Q3V038 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ttc9Q3V038 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ttc9Q3V038 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc9Q3V038 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc9Q3V038 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc9Q3V038 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc9Q3V038 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc9Q3V038 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc9Q3V038 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc9Q3V038 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc9Q3V038 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc9Q3V038 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc9Q3V038 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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