Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn13Q3UW68 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms