Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
E130208F15RikQ3UPV3 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms