Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rnf224Q3UIW8 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf224Q3UIW8 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms